Фильм рассказывает о неожиданном воссоединении Шарлотты Филд, целеустремлённой госсекретаря США, готовящейся к важной зарубежной миссии с новой экологической инициативой, и Фреда Фларски, циничного журналиста, только что потерявшего работу. Их случайная встреча на вечере приводит к тому, что Шарлотта предлагает Фреду стать её спичрайтером, ведь он умеет говорить на языке обычных людей.
После событий фильма «Дни минувшего будущего» мир все еще не пришел к миру между мутантами и людьми, а противостояние только нарастает. В этот сложный период на Земле пробуждается древнее существо, первым получившее мутационные способности — Апокалипсис, который провел в заточении тысячи лет и теперь хочет полностью стереть существующую цивилизацию, чтобы построить мир по своим правилам.