Фильм «Прерванная темнота» переносит зрителя в мир, переживший апокалипсис, вызванный метеоритным дождём. Основное действие разворачивается под землёй, где главный герой Сэм, его друг Трой и загадочная девушка Роуз пытаются найти убежище и выжить. Их путь лежит через заброшенные тоннели и подземные комплексы, превратившиеся в логово чудовищных мутировавших существ, заполонивших поверхность.
Война Федерации против враждебной инопланетной расы арachнидов не утихает после событий предыдущих частей саги, а переходит в новую, еще более ожесточенную фазу, где каждая планета может стать полем боя, а каждый вылет звездолета — риском никогда не вернуться домой. Именно на планете OM-1 происходит катастрофа: там терпит крушение звездолет Федерации, на борту которого оказались как...