После событий первой части франшизы мутанты оказались на пороге открытого конфликта с обществом, которое всё больше опасается людей с необычными способностями. Общественное напряжение выливается в активные дискуссии о необходимости обязательной регистрации всех носителей гена мутации, а против мутантов формируется открытое движение, возглавляемое бывшим военным Уильямом Страйкером.
