После событий первого фильма синий ёжик Соник обретает подобие дома в спокойном Грин-Хиллсе, но его стремление стать настоящим героем остаётся неутолённым. Зов приключения звучит немедленно: гениальный и безжалостный доктор Эггман (Роботник) возвращается с амбициозным планом, теперь опираясь на силу загадочного и могучего воина-ежа Наклза.
Яркий и самоуверенный ёжик Соник, пришедший из параллельной реальности, оказывается на тихой американской farmscape, где его уникальные способности могут привлечь нежелательное внимание. Чтобы скрыться от преследований и понять, как жить на новой планете, он находит неожиданного союзника в лице Тома, местного шерифа, мечтающего о карьере в большом городе.