Фильм «Мой друг Зигмунд Фрейд» переносит в Вену конца 1930-х, где мирный уклад рушится под натиском нацизма. Главный герой, молодой Франц из провинции, устраивается продавцом в табачный магазин на вокзале. Эта скромная работа открывает ему доступ к интеллектуальной жизни города. Судьба сводит его с пожилым, больным раком, но ясномысленным Зигмундом Фрейдом.
Спокойная идиллия небольшого городка Винден, затерянного среди лесов и озер, рушится в один миг, когда пропадают два ребёнка. Это событие становится спусковым крючком для раскрытия глубоко запрятанных тайн, которые связывают четыре местные семьи — Дённерс, Нильсен, Допплер и Кранц — в сложную паутину лжи, предательства и скрытых мотивов.
Двадцать три года назад в жаркий летний день в пшеничном поле на окраине небольшого западногерманского городка нашли зверски убитую молодую девушку по имени Пиа. Следствие зашло в тупик, дело так и осталось нераскрытым, а местные жители понемногу забыли о случившемся, погрузившись в обычную размеренную жизнь.