В фильме «Подводное волшебство» переплетаются судьбы двух миров, существующих параллельно и в симбиозе. В человеческом королевстве правит добрый, но ослабленный горем вдовец король Георг, чья единственная дочь, принцесса Ханна, внезапно тяжело заболевает. В это время в невидимом для людей подводном царстве восседает мудрая Водяная царица, управляющая своими помощниками и хранящая древнюю тайну.
Контекст начала Второй мировой войны: оккупированная немецкими войсками Чехословакия, распущенная национальная армия, а несколько военных летчиков отказываются смириться с потерей независимости и свободы. Они решают бежать из страны, чтобы продолжать воевать против агрессора, и их долгий путь лежит сначала в Польшу, потом в Ливию, и только после этого они попадают в Великобританию, где их...