Четвертая часть культовой франшизы о сверхчеловеческих солдатах переносит зрителей в мрачную, пропитанную насилием реальность, где границы между человеком и оружием стерты до предела. Главный герой, Джон, приходит в себя после долгой комы и узнаёт страшную новость: в его дом ворвались неизвестные, убили жену и маленькую дочь.
После событий первого фильма Нео окончательно осознает, что он Избранный, способный изменить правила Матрицы и освободить человечество из плена машин. Но путь к этой цели оказывается куда сложнее, чем казалось: восстание людей сталкивается с новыми угрозами, а сама система контроля над человечеством проявляет неожиданные особенности.